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Essa discrepância entre o "relógio molecular" (análise filogenética de DNA) e o registro fóssil é um dos temas mais debatidos na biologia evolutiva. Embora modelos moleculares sugiram que ancestrais da linhagem dos primatas surgiram no final do Cretáceo (cerca de 85 a 100+ milhões de anos atrás), os fósseis confirmados de primatas/protoprimatas não vão além de 66-56 milhões de anos

A fossilização é um evento raro. Os ancestrais primatas eram, provavelmente, pequenos, arborícolas (viviam em árvores) e habitavam florestas tropicais. Ambientes de floresta são ácidos e quentes, o que dificulta a preservação de ossos, ao contrário de bacias sedimentares ou desertos.
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Pelo que entendo nós nem deveríamos encontrar fóssil algum.

Quando uma pessoa morre e é sepultada os ossos desintegram em menos de 100 anos.

Encontrar fósseis de milhões de anos não faz sentido.
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A depender das condições que o indivíduo morreu, os ossos podem ser preservados melhor ou não. Por exemplo, pântanos... A lama possui condições favoráveis para fossilizar.

Assim como mumificação frequentemente acontece por vias naturais também.

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